向島歯科医師会の誕生は大正年間に遡り、東京府南葛飾郡歯科医師会にその源を発している。
昭和７年東京に区制がしかれ、同年１０月東京市との合併に伴い南葛飾郡歯科医師会は、城東、葛飾、江戸川、向島歯科医師会に、各々独立した。
昭和８年４月1日西嘉郎初代会長とともに新生向島歯科医師会は誕生した。この時上条美友先生の基で向島学校歯科医会も誕生した。
しかし戦時中は、診療資材の確保、配給が会の主要事業となり、終戦の混乱期は、一時、会の機能を全く停止せざるを得なかった。
戦後、世の中の復興、新憲法発布等、国家体制が再び確立され、昭和２３年４月、社団法人として本会が復活した。
昭和３０年、社団を解散し、東京都歯科医師会の支部となったが、昭和４４年、木村哲男会長は再び本会を社団法人となし、上野昇一郎会長が昭和５３年７月２２日に会館を完成させ、現在に至っている。